Licenciada en Filosofía y Letras por la Universidad de Sevilla, donde se doctoró en Historia de América en 1972, es especialista en historia económica, de las relaciones entre España y América y de la trata de esclavos. Hasta 2015 ha sido profesora investigadora en el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) donde dirigió distintos proyectos en la Escuela de Estudios Hispano-Americanos, entre otros, Estructura comercial y poder en la colonización de América y Relaciones de poder y comercio colonial: Sevilla y Cádiz como modelos o Presencia italiana en Andalucía y América. También ha dirigido distintas publicaciones especializadas como Historiografía y Bibliografía Americanistas y Anuario de Estudios Americanos.
Enriqueta Vila es académica numeraria de la Real Academia Sevillana de Buenas Letras (1995), institución que dirigió y de la Real Academia de la Historia; académica correspondiente de la Academia Dominicana de la Historia (1995) y Academia Mexicana de la Historia (2002). Además, ha sido patrona de la Fundación Pública Andaluza Centro de Estudios Andaluces y pertenece al consejo del Instituto de la Cultura y de las Artes de Sevilla (ICAS)
Ha sido galardonada con la Medalla de Andalucía (2003), la Medalla de Oro de la Diputación de Sevilla, el Premio del Cabildo Alfonso X el Sabio y el de periodismo Joaquín Romero Murube que otorga el Diario ABC en su edición sevillana, entre otros.
Sobre su producción académica y divulgativa, ha publicado una treintena de libros y un centenar de artículos en revistas académicas y de divulgación. Entre los libros destacan:
• Afroamérica. Textos históricos. Temáticas para la Historia de Iberoamérica, serie II. Colección Clásicos Tavera CD ROM. Madrid.
• Hispanismo e Hispanización: el Atlántico como Nuevo Mare Nostrum,
• Hispanoamérica y el comercio de esclavos, Universidad de Sevilla
• Hispanoamérica y el comercio de esclavos. (Los asientos portugueses), CSIC.
• Los abolicionistas españoles del siglo XIX, junto con Luisa Vila Vilar
• Los Corzo y los Mañara, Universidad de Sevilla.